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重叠细胞分割

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  • 上传时间:2021-06-29
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  • 标      签: Matlab

资 源 简 介

对于细胞图像序列中多目标的追踪是细胞运动研究中的难点,针对高密度细胞图像中细胞运动的复杂性,本文提出一个细胞分割和追踪的系统。在细胞分割部分,针对实验所用细胞图像序列的特点,本文分别采用了不同的分割方法。在基本的细胞分割后,由于得到的分割图像存在着一些粘连细胞,为了将之分离,采用了基于Freeman code法对细胞轮廓进行跟踪编码。根据编码所得的链码特征分析细胞的轮廓形态,找出粘连细胞图像中的凹角点,再将凹角点进行分组配对完成粘连细胞的分离。在追踪部分,针对细胞的运动特性,将细胞分为惰性细胞和非惰性细胞,分别采用区域重叠法和拓扑约束法进行追踪。针对高密度细胞追踪中由于细胞密集加上细胞分裂很容易导致错误追踪的问题,本文提出将面积项引入实现追踪的拓扑约束条件中,对原方法进行改进,有效的解决了这一问题,有助于提高追踪效率,特别是对于细胞密度比较大,且分裂频繁的细胞图像效果明显。另外,本文提出根据细胞数量设置产生图的距离门限,使算法的适用性更强 。

文 件 列 表

work
candidate.m
dist.m
dist_angle.m
flows.m
ID_link.m
ID_link1.m
ID_link4.m
IEEEXplore[1].pdf
match2.asv
match2.m
match21.asv
match21.m
segframe1.tif
segframe10.tif
segframe100.tif
segframe11.tif
segframe12.tif
segframe13.tif
segframe14.tif
segframe15.tif
segframe16.tif
segframe17.tif
segframe18.tif
segframe19.tif
segframe2.tif
segframe20.tif
segframe21.tif
segframe22.tif
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segframe3.tif
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segframe49.tif
segframe5.tif
segframe50.tif
segframe51.tif
segframe52.tif
segframe53.tif
segframe54.tif
segframe55.tif
segframe56.tif
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segframe58.tif
segframe59.tif
segframe6.tif
segframe60.tif
segframe61.tif
segframe62.tif
segframe63.tif
segframe64.tif
segframe65.tif
segframe66.tif
segframe67.tif
segframe68.tif
segframe69.tif
segframe7.tif
segframe70.tif
segframe71.tif
segframe72.tif
segframe73.tif
segframe74.tif
segframe75.tif
segframe76.tif
segframe77.tif
segframe78.tif
segframe79.tif
segframe8.tif
segframe80.tif
segframe81.tif
segframe82.tif
segframe83.tif
segframe84.tif
segframe85.tif
segframe86.tif
segframe87.tif
segframe88.tif
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segframe9.tif
segframe90.tif
segframe91.tif
segframe92.tif
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segframe96.tif
segframe97.tif
segframe98.tif
segframe99.tif
weight.m

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