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方法:对贪婪的16S rRNA聚类软件读取

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  • 上传时间:2021-06-30
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  • 标      签: 软件 读取 方法 贪婪

资 源 简 介

Summary: Pyrosequencing technologies are frequently used for sequencing the 16S rRNA marker gene for profiling microbial communities. Clustering of the produced reads is an important but time-consuming task. We present DySC, a new tool based on the greedy clustering approach which uses a dynamic seeding strategy. Evaluations based on the normalized mutual information criterion shows that DySC produces higher quality clusters than UCLUST and CD-Hit at a comparable runtime.

文 件 列 表

DySC_01_June_2012
manual.pdf
DySC_v06-01-2012

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