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范围+ +:均聚物的排放顺序分类

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  • 上传时间:2021-06-30
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资 源 简 介

Background SCOPE++ is a C++-based program for accurately identifying homopolymer in cDNA sequences using Hidden Markov Models. This can be extended to trimming poly(A)/poly(T) tails, or identifying A,C,G,T,or N homopolymer sequences. Getting Started gunzip SCOPE.tar.gztar -xf SCOPE.tar To compile the executable run the following make To test if the executable is working ./SCOPE++ -i test.fa -o test_folder An Arabidopsis dataset for testing can be found at the following link http://conifergdb.muohio.edu/data/release/ArabidopsisIlluminapolya.fastq.tgz Don"t forget to consult the README for more information

文 件 列 表

SCOPE++
license.txt
README

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