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K-means 和 BPSO

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  • 上传时间:2021-06-29
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  • 标      签: Matlab matlab

资 源 简 介

应用背景 虽然传统的基因选择方法已经能够取得很好的效果,选出的基因子集有利于后续样本分类,但是这些方法主要考虑数据方差和分布的相关性,从而选出的基因可解释性较差且冗余度较高。为了获得最小冗余可解释的基因子集,本文在充分考虑基因类别灵敏度 (Gene to class sensitivity,GCS) 信息和基因调控 (Gene regulation,GR) 信息的基础上,利用二进制微粒群算法(BPSO)和极限学习机(ELM)进行基因选择。 关键技术该方法提出用PSO优化K均值聚类,并在此基础上确定初始化种群,随后运用两个BPSO分别结合GCS和GR信息进行进行选择。在多个基因表达谱数据上的实验结果表明,相比BPSO-GCS-ELM和其他一些经典的基因选择方法,该方法能够选出更紧凑且分类能力更强的基因子集。

文 件 列 表

BPSO.m
kmeans.m

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